Née à Linz, Anna Maria Pammer est une ancienne élève du Lycée musical de cette ville. Elle poursuit ensuite des études de chant, de violoncelle, de Lied, d’oratorio et de drame musical au Conservatoire national de Vienne. Puis elle devient membre du Studio lyrique internatio-nal de l’Opéra de Zurich. Sa participation à « Der Schuhu und die fliegende Prinzessin » de Udo Zimmermann sous la direction du compositeur, au Festival de Salzbourg puis à l’Opéra de Leipzig en 1995, lui vaut un de ses premiers grands succès. Depuis, elle s’est produite à l’Opéra de Paris, au Volksoper et à l’Opéra de Cologne.
Depuis des années, Anna Maria Pammer travaille avec des ensembles et des solistes aussi réputés que l’Orchestre Symphonique de Vienne, la Chapelle Royale, les Orchestres de la RAI de Turin, l’Orchestre Symphonique du SWR ou le Bruckner-Orchester sous la direction de chefs tels que Adam Fischer, Sir Roger Norrington, Dennis Russell Davies, Philippe Herre-weghe et Franz Welser-Möst. En musique de chambre elle a notamment chanté avec le Quatuor Arditti, le Quatuor Hagen, Patricia Kopatchinskaja et Gidon Kremer.
De 2007 à 2010 Anna Maria Pammer fut « Artiste en résidence » au Bruckner-Haus de Linz où elle a réalisé des programmes caractérisés par une dramaturgie sophistiquée. Elle a ainsi dirigée des concerts-conversation consacrés aux quatuors de Schönberg et mise en scène des soirées consacrées à Hildegard von Bingen, Ludwig Wittgenstein, Cathy Berberian, la « musique dégénérée » dénoncée par les nazis et à Barbara Strozzi.
Anna Maria Pammer est co-fondatrice et directrice artistique du Festival austro-arménien à Erevan.
La discographie d’Anna Maria Pammer compte environ 25 titres. Récemment sont sortis un enregistrement complet des « Lieder pour la jeunesse op. 79 » de Robert Schumann ainsi que la création « Ludwig Wittgensteins Tractatus logico-philosophicus für Sopran Solo » de Balduin Sulzer.