Nata a Linz nell'Alta Austria, Anna Maria Pammer, dopo avere completato il Ginnasio Musicale di Linz, ha studiato canto, violoncello, Lied, Oratorio ed Opera all'Università della Musica e delle Arti dello Spettacolo a Vienna. In seguito divenne membro dell'International Opera Studio all'Opera di Zurigo.
La Signora Pammer ha conseguito il suo primo grande successo cantando in "Il Gufo reale e la Principessa volante" di Udo Zimmermann, sotto la direzione del compositore al Festival di Salisburgo e all'Opera di Lipsia. Si è esibita anche alla Vienna Volksoper e alla Vienna Kammeroper e nei teatri di Ulm, Darmstadt, Colonia, Düsseldorf, San Gallo e Klagenfurt, e collabora regolarmente con la Neue Oper Wien e NetzZeit.
Il suo repertorio spazia dalla musica medievale alla musica del Ventesimo e del Ventunesimo Secolo, e il repertorio contemporaneo raccoglie il suo particolare interesse. Ha cantato con importanti formazioni, come l'Orchestra Sinfonica di Vienna, la RSO di Vienna, le orchestre della RAI di Torino e del Teatro La Fendice, la Haydnphilharmonie, la Brucknerorchester, la Chapelle Royale, il Klangforum Wien, la Statni Filharmonie Brno e la MDR Kammerphilharmonie, sotto la direzione di maestri come Adam Fischer, Sir Roger Norrington, Rudolf Barschai, Gary Bertini, Bertrand de Billy, Roberto Abbado, Philippe Herreweghe, Johannes Kalitzke, Peter Rundel, Caspar Richter e Franz Welser-Möst.
Per la musica da camera, moltissimi sono stati i suoi partners, fra gli altri il quartetto Arditti, il quartetto Hagen, il quartetto Aron, il trio di Vienna, i violinisti Patricia Kopatchinskaja, András Keller e Gidon Kremer.
Vertici di questa stagione concertistica sono rappresentati certamente dalle sue interpretazioni dei "Kafka Fragments" di G. Kurtág, accompagnata dai violinisti András Keller e Patricia Kopatchinskaja, all' Amsterdam Concertgebouw , a Brussels, Basilea. Interpreterà questo capolavoro anche a Padova, per la Stagione concertistica degli Amici della Musica, con la violinista Patricia Kopatchinskaja.
Nella stagione scorsa ha riscosso grande successo al Donaueschingen Festival e all'Opera Nazionale di Parigi.